Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms