Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PtprfA2A8L5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms