Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms