Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms