Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdfS4R2K0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms