Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms