Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms