Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip2Q9Z0H8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms