Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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