Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nme3Q9WV85 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nme3Q9WV85 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme3Q9WV85 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms