Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn4Q9WU22 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms