Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbnQ9R207 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms