Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms