Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr54Q9R0D8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms