Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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