Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms