Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms