Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc3Q9QZC1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc3Q9QZC1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms