Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms