Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms