Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apbb1Q9QXJ1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms