Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc5Q9QX29 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms