Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms