Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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