Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms