Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms