Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms