Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms