Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aff4Q9ESC8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms