Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms