Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms