Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms