Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms