Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pop5Q9DB28 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pop5Q9DB28 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pop5Q9DB28 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pop5Q9DB28 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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