Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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