Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms