Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp4bQ9D8B3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4bQ9D8B3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms