Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem54Q9D7S1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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