Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Echdc3Q9D7J9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms