Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms