Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms