Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop56Q9D6Z1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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