Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms