Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms