Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms