Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms