Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcc1Q9D4H2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms