Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem35aQ9D328 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms