Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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