Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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